Метод биоэстимации позволяет осуществлять контроль состояния специфических микроорганизмов в активном иле и использовать результаты для прогнозирования изменения качества очищенной воды, а также иметь возможность применить меры, минимизирующие негативное влияние факторов или определить источник факторов.